En esta zona del río podremos disfrutar de diferentes especies de cíclidos (Neolamprologus Brichardi, etc.), muchas de ellas endémicas de estos lagos. Se trata de destacar la fragilidad y valor ecológico de los endemismos, frente a las especies introducidas por el hombre (perca del Nilo).
Según WWF el Río Nilo se encuentra entre los 10 ríos más amenazados del mundo debido al Cambio Climático, la extracción masiva de agua del caudal del río y la introducción de especies exóticas.
Continuamos el recorrido por el curso medio del Río Nilo, donde las aguas fertilizan una estrecha franja de las orillas mientras que, más allá, se extiende el tórrido desierto.
En esta zona podremos disfrutar del gran cocodrilo de Nilo (Crocodrylus niloticus), del varano del Nilo (Varanus niloticus), la rana de uñas africana (Xenopus laevis) entre otras especies.
Finalmente llegamos al curso bajo del río, donde podremos disfrutar de tilapias (Tilapia buttikoferi), peces, gato, etc.
En particular ése río africano es muy sensible al cambio climático, con el incremento de la temperatura, la evaporación de las aguas del Nilo también aumenta, además el hombre cada vez necesita más aguas para regar sus cultivos, el incremento del nivel del mar también hace que el agua salada desplace al agua dulce en las zonas costeras.